一、性质不同糖蛋白：一种含有寡糖链的蛋白质，两者之间以共价键相连。

2、蛋白聚糖：一类特殊的糖蛋白，由一条或多条糖胺聚糖和一个核心蛋白共价链接而成。

二、连接方式不同糖蛋白连接方式：（1）N-糖苷键型：寡糖链（GlcNAC的β-羟基）与Asn的酰胺基、N-未端的a-氨基、Lys或Arg的W-氨基相连（2）O-糖苷键型：寡糖链（GalNAC的α-羟基）与Ser、Thr和羟基赖氨酸、羟脯氨酸的羟基相连。

（3）S-糖苷键型：以半胱氨酸为连接点的糖肽键。

（4）酯糖苷键型：以天冬氨酸、谷氨酸的游离羧基为连接点。

2、蛋白聚糖连接方式：（1）GlcUAβ(1→3)Galβ(1→3)Xylβ1-O-Ser，属O-寡糖链；聚糖的二糖单位（己糖醛酸→己糖胺）装配在它的非还原端GlcUA上。

（2）软骨可聚蛋白中的连接区是另一形式的O-寡糖链，即O-GalNAc糖链，这是一个分支的六糖链，Siaα2→3Galβ1→4GlcNAcβ1→6(Siaα2→3Galβ1→3)GalNAcα1-O-Ser/Thr。

扩展资料：蛋白聚糖的种类：（1）大分子聚集型胞外基质蛋白聚糖。

（2）小分子富含亮氨酸胞外基质蛋白聚糖。

（3）跨膜胞内蛋白聚糖。

2、糖蛋白生物学功能：糖蛋白寡糖链末端的唾液酸残基，决定着某种蛋白质是否在血流中存在或被肝脏除去的信息。

脊椎动物血液中的铜蓝蛋白。

肝细胞能降解丢失了唾液酸的铜蓝蛋白，唾液酸的消除可能是体内“老”蛋白的标记方式之一。

参考资料来源：百度百科-糖蛋白参考资料来源：百度百科-蛋白聚糖。