通用的， 没什么区别。

推荐写作“启航”。

“起航”是异形词，不推荐使用（可以参考国家发布的异形词整理表）。

另外，首次航行叫“首航”。

启航和起航，没有什么区别，可以通用。

用于车、船、飞机开始上路意思，二者可以互用。

例如： [启程]起程，上路；---见《现代汉语词典》889页 [启运]起运，；---见《现代汉语词典》889页 [起程]上路，行程开始；；---见《现代汉语词典》891页 [起航]轮船出发，；---见《现代汉语词典》891页 但是，有的地方不通用： 例如； [起跑][起步]，不能写为：启跑，启步。