运九飞机全新设计了飞机外形及机体结构、飞行控制系统、货运系统，使用当量功率为5100EHP（当量马力）的FWJ-6C型涡轮螺旋桨发动机，并配装了6叶大后掠角的JL-4型复合材料螺旋桨。

FWJ-6C发动机技术成熟、工作稳定可靠，功率大、油耗低，JL-4复合材料螺旋桨重量轻、效率高、噪声低。

使用FWJ-6C发动机及JL-4螺旋桨后，运九飞机具有了很好的高温、高原性能。

起落架支柱进行了优化改进设计以提高承载能力；起落架采用优质锻铝合金机轮，使用无内胎的低压扁平轮胎，提高起落架漂浮性能，配置了碳-碳复合材料刹车盘，机轮的刹车控制采用了数字式电子防滑系统，保证运九可以在松软、粗糙的跑道或地面上起降。

机体结构的优化设计使得运9的使用寿命得到全面提高，在各种复杂的环境下都能长期有效地可靠工作。