1.商业部专业部：设有港口与航运管理（五年专）、物流管理（五年专）、物流服务与管理、商务英语、商品经营等专业，商品经营专业是国家级示范性建设的专业，商务英语、物流服务与管理均为市级示范专业。

2.旅游专业部：现有旅游管理、酒店管理、导游与旅行社、空乘与涉外礼仪、空港服务与营销、幼儿教育、烹饪艺术、烹饪与管理、调酒与西餐等专业。

3.汽车专业部：汽车部设有汽车运用与维修、新能源汽车维修、汽车整车与配件营销(汽车商务)专业。

汽车运用与维修专业是国家级示范专业。

4.信息工程部：信息工程部设有计算机网络技术专业、网络信息安全专业、数字媒体技术应用专业、动漫设计与游戏制作专业、电子商务专业。

5.财会专业部：厦门工商旅游学财会专业部主要是在原厦门商业学校财务会计专业（省级重点专业）基础上组建起来的实施二级管理的专业部门。

参考资料来源：厦门工商旅游学校官网-商业部简介参考资料来源：厦门工商旅游学校官网-旅游部简介参考资料来源：厦门工商旅游学校官网-汽车部简介参考资料来源：厦门工商旅游学校官网-信息工程部专业介绍参考资料来源：厦门工商旅游学校官网-财会部简介。