基层医疗机构一般情况下是指最小的行政区划级别的医疗机构。

现在的基层从广义上来讲是指县一级的医疗机构和小型社区卫生医疗站（或者医疗救助中心）。

现机构的大致定位是：县级医院为龙头、乡镇卫生院为骨干、村卫生室为基础。

其中，乡镇卫生院负责提供公共卫生服务和常见病、多发病的诊疗等综合服务，并承担对村卫生室的业务管理和技术指导等工作；村卫生室承担行政村的公共卫生服务及一般疾病的诊治等工作。

有条件的农村可以实行乡村一体化管理。