主要是看主办方和参加对象来区分。

座谈会：主要是用以行政领导牵头，下属部门参加的交流会议。

恳谈会：主要是用以平等阶层或邀请领导层参与的交流会议。

区别不是很大，但中国人就是喜欢文字游戏。

相对来说，恳谈会更低姿态一点，座谈会就带点行政或命令性质了。

个人见解，也不知道对不对啊~~~~~~~。